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O povoado de Messejana originou-se de uma antiga aldeia indígena da nação Potiguara, que a partir de 1607 abrigou um aldeamento de jesuítas. O lugar passou então a se chamar Aleia de São Sebastião de Paupina. A palavra paupina vem de Padre Pina, o missionário fundador do aldeamento.
Mais tarde, Messejana foi incorporada à vila de Fortaleza. Em 1760, o povoado foi elevado à condição de vila independente e, em  1839, voltou a fazer parte de Fortaleza. De 1878 a 1921, tornou-se um município autônomo. Hoje, Messejana é um dos distritos da cidade de Fortaleza.
Fonte: História Ceará - Renata Paiva